[Окончание] Новогодний детектив: странный хайзенбаг в «питоньих» часах

А он не сломан (мы это выяснили еще в первой части, ну и здесь видно):
трейсинг показывает что clock_gettime(CLOCK_REALTIME) возвращает корректные значения

Но если хотите - добавлю.

А просто при делении 1642516506243048649 / 1e9 получается воспроизвести неправильный результат?

Думаю что временами да, но... спросить чего и ждать потом 2-3 дня (а он как говорилось уже, нукуда не торопится), то такое.

там два действия int64->double и потом деление. Можете оба действия залогировать.

Можно, то оно можно, токма с хайзенбагами осторожно нужно - они чем больше их дебажишь или обвешиваешь логами, тем хуже воспроизводятся, плавали - знаем (приходилось по роду деятельности бороться).

Но глюк точно не связан с памятью, т.к. значения еще не покидало кэш первого уровня

Вот про кеш я бы не был так уверен, ибо 1) вымывается он всякой паразитной дрянью, да на виртуалке то, и 2) та же внезапная запись рядом в том же неудачно выравненном блоке памяти другим каким потоком может вызвать invalidate для всего куска что в L2, а затем и в L1 (я про согласованность кеша и когерентность памяти). Он у Ryzen9 3900X хоть и большой (если не ошибаюсь 64MB), но под виртуалку ему отдали всего 512K судя по инфо о системе:
Info: Single Core model: AMD Ryzen 9 3900X bits: 64 type: UP L2 cache: 512 KiB
опять же на single core model там контекст-свич контекст-свичем погоняет.

Вот только слишком уж "консистетные" результаты для битой памяти, при том если то память, то здесь действительно стэк (это не объекты питона из кучи). А битый стек должен бы худо бедно сегфолтить где-то еще, а этого нет и в помине судя по всему.

Дело в том что 1642516506243048649 не влазит в double и получиться 1642516506243048704.

Оно и понятно, только на нормально работаюшей системе это поменеят несколько десятков наносекунд (55 если быдь точным), но никак не секунды т.е. при делении на лярд как бы не очень важно в контексте статьи - время, округленное до миллисекунд, как было 1642516506.243 так и останется 1642516506.243.