Из того, чем я пользовался — intuit.ru. Много курсов, бесплатный доступ. К сожалению много устаревшего материала, но найти неплохой курс можно.

А красные буквы на белом фоне это на самом деле фейспалм. Где их только учат этому?

Я не считаю себя умнее других и никого не поучаю, я лишь высказал свое мнение.

"… привлекли к администрированию десяти сайтов, расположенных на одном виртуальном хостинге. Сайты крутились на “полуразложившихся” движках, написанных в 2000-2003 годах..."

По-видимому ни репозитория, ни бекапов сайта не знавали.